伴随着渡来人的移入，日本在弥生时代初期出现了陶器、铁、铜器以及水田等文化，使日本逐渐成为一个农业社会，弥生时代中期，位于九州的奴国国王向汉朝朝贡，并获赐金印。
弥生时代中、后期的日本，在《后汉书·东夷传》和《三国志·魏志·东夷传》中有比较详细的记载。当时日本总称为“倭”，分成许多小国，有“王”、“大夫”、“下户”、“生口”等不同的阶级和阶层。汉光武帝建武中元二年（公元57），“倭奴”国曾遣使到洛阳，汉朝赐其王以金印（见汉委奴国王金印）。汉安帝永初元年（107），倭国王帅升又遣使来朝，并献上“生口”（奴隶）。
到了三国时期，邪马台国成为许多小国的共主，其女王卑弥呼于景初三年(239)遣使到洛阳，魏帝赐“亲魏倭王”金印及锦缎、铜镜等各种礼物，由带方郡派官吏回访。此后，邪马台国又多次与中国交往。关于邪马台国的所在地，学术界有两种不同意见，即“九州说”与“畿内说”，长期争论，至今未有定论。
到了三国时期，邪马台国成为许多小国的共主，其女王卑弥呼于景初三年(239)遣使到洛阳，魏帝赐“亲魏倭王”金印及锦缎、铜镜等各种礼物，由带方郡派官吏回访。此后，邪马台国又多次与中国交往。关于邪马台国的所在地，学术界有两种不同意见，即“九州说”与“畿内说”，长期争论，至今未有定论。
有人认为弥生人与弥生文化来自中国的吴与越,有日本倭人来自吴太伯的说法,日本倭人的水稻品种是来自浙江省一带,文化上日本人称为照叶树林文化
到了公元2世纪后半期，各小国内战频繁，直至3世纪中叶才出现较大的“大和国”，后经过长期的扩张，并且逐渐征服了日本中部大部分地方，其首领最初称为“大王”，后来改称天皇。
大和国日益强盛起来，日本也从弥生时代开始逐渐过渡到古坟时代。
大和国日益强盛起来，日本也从弥生时代开始逐渐过渡到古坟时代。
在弥生时代，也即公元前三世纪前后，原本发展缓慢的日本原始社会突然一夜暴富，飞跃进全新的农业社会。通过对大量出土文物和遗址的深入研究，日本考古学家认为，弥生时代的跨越根本在于中国秦汉时期的移民入岛。他们带来了大陆先进的农耕文明，给日本列岛带入全新气象。
随着移民到来，弥生人陆续从潮湿阴冷的沿海地带迁移到广袤的平原，建起干栏式房屋，制成美丽的麻布衣服。在基本解决温饱问题之后，女人开始享有比以往更多的首饰和其他装饰品。如手镯和项链。随着农业社会的兴起，男性在部落中的作用凸显，地位逐渐提升，原始社会逐步向阶级社会过渡，这一变化最明显的标志是墓葬的规格和随葬品的多寡的变化。
这个被后人命名为“弥生”的时代，在其步入后期之后所要展开的一系列故事，将彻底将日本列岛带入与绳纹时代和早期弥生时代迥然不同的全新时代，最终把日本一步步引向奴隶制社会。